Amb motiu de la creació de la parròquia de Sant Lluc i Santa Llúcia, i degut a les noves normes litúrgiques del Concili Vaticà II, moltes de les obres d'art de l'ermita, especialment els grans llenços (Mare de Deú dels Desemparats, Sants de la Pedra, Sant Isidre, Judici Final, bocaport de Santa Llúcia) així com el púlpit desmuntat i altres elements foren ubicats en la Sala Gran i adjacents, en forma de "Museu", que es mostrava als visitants interessats.
